MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 10004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019965	GGC	2	6	2299283	2299288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_019965	CA	3	6	2300857	2300862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_019965	GGC	2	6	2300864	2300869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_019965	ACC	2	6	2300987	2300992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_019965	TGG	2	6	2301015	2301020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_019965	TCG	2	6	2302406	2302411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_019965	GGTC	2	8	2302456	2302463	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_019965	TCA	2	6	2302477	2302482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_019965	CGG	2	6	2302521	2302526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_019965	CGGT	2	8	2302528	2302535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_019965	TC	3	6	2303215	2303220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_019965	CCG	2	6	2303260	2303265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_019965	CA	3	6	2303306	2303311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_019965	TCC	2	6	2303322	2303327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_019965	AGC	2	6	2303335	2303340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_019965	ACG	2	6	2303383	2303388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_019965	CCA	2	6	2303389	2303394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_019965	ACC	2	6	2303419	2303424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_019965	CGC	2	6	2303433	2303438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_019965	TCGGCG	2	12	2303475	2303486	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_019965	CGC	2	6	2303712	2303717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_019965	CAC	2	6	2303766	2303771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_019965	CTT	2	6	2307186	2307191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_019965	GCA	2	6	2307230	2307235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_019965	CG	3	6	2307309	2307314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_019965	GGA	2	6	2307364	2307369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_019965	CGC	2	6	2307448	2307453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_019965	ATG	2	6	2307509	2307514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_019965	GCA	2	6	2307526	2307531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_019965	GAT	2	6	2307549	2307554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_019965	GAC	2	6	2307672	2307677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_019965	TGG	2	6	2307709	2307714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_019965	CCG	2	6	2307733	2307738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_019965	TCA	2	6	2307747	2307752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_019965	CAT	2	6	2307772	2307777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_019965	GGTG	2	8	2307797	2307804	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_019965	GGC	2	6	2312671	2312676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_019965	CCAAC	2	10	2312710	2312719	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5039	NC_019965	ACCGC	2	10	2312731	2312740	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5040	NC_019965	GT	3	6	2312849	2312854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_019965	CTT	2	6	2312925	2312930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_019965	TCG	2	6	2312963	2312968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_019965	TG	3	6	2313014	2313019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_019965	GCC	2	6	2313069	2313074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_019965	ACG	2	6	2313125	2313130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_019965	GCC	2	6	2313146	2313151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_019965	GCA	2	6	2314181	2314186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_019965	ACC	2	6	2314207	2314212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_019965	AAGC	2	8	2314213	2314220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_019965	ATA	2	6	2314245	2314250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_019965	CAAC	2	8	2316950	2316957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5052	NC_019965	CCT	2	6	2321352	2321357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_019965	TGT	2	6	2321482	2321487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_019965	CCG	2	6	2321495	2321500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_019965	GCC	2	6	2322543	2322548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_019965	GAT	2	6	2322584	2322589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_019965	CG	3	6	2322625	2322630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_019965	CT	3	6	2323514	2323519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_019965	CGC	2	6	2323529	2323534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_019965	CGC	2	6	2323539	2323544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_019965	CGG	2	6	2323582	2323587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_019965	CAC	2	6	2323654	2323659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_019965	GAA	2	6	2323675	2323680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_019965	GAC	2	6	2325139	2325144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_019965	CCA	2	6	2331658	2331663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_019965	ACC	2	6	2332013	2332018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_019965	ACG	2	6	2332028	2332033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_019965	TC	3	6	2332044	2332049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_019965	GGGGC	2	10	2333656	2333665	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5070	NC_019965	ACG	2	6	2334360	2334365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_019965	CCG	2	6	2349441	2349446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_019965	CCG	2	6	2349457	2349462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_019965	TGC	2	6	2349475	2349480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_019965	ACG	2	6	2349486	2349491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_019965	CGT	2	6	2349493	2349498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_019965	CCCG	3	12	2349620	2349631	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5077	NC_019965	GGT	2	6	2349669	2349674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_019965	GC	3	6	2349931	2349936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5079	NC_019965	CGG	2	6	2349976	2349981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_019965	GTCAC	2	10	2350003	2350012	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5081	NC_019965	CAC	2	6	2350018	2350023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5083	NC_019965	CGCGC	2	10	2350107	2350116	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5084	NC_019965	CAG	2	6	2350191	2350196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5087	NC_019965	CGG	2	6	2353260	2353265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_019965	ACG	2	6	2356294	2356299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5090	NC_019965	TAT	2	6	2356351	2356356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_019965	TCC	2	6	2357005	2357010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_019965	CCCT	2	8	2358360	2358367	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5093	NC_019965	AAT	2	6	2358434	2358439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_019965	TGT	2	6	2358446	2358451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_019965	AGG	2	6	2358457	2358462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_019965	TTC	2	6	2365437	2365442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_019965	GACTA	2	10	2365496	2365505	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5099	NC_019965	GTA	2	6	2371493	2371498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5101	NC_019965	CGC	2	6	2371538	2371543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5103	NC_019965	CGG	3	9	2371559	2371567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5106	NC_019965	TCG	2	6	2374884	2374889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5108	NC_019965	TCG	2	6	2377621	2377626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_019965	GCC	2	6	2377647	2377652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_019965	GAC	2	6	2377984	2377989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_019965	GAA	2	6	2379333	2379338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_019965	ACC	2	6	2379344	2379349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_019965	CA	3	6	2379375	2379380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_019965	CAC	2	6	2379400	2379405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_019965	GT	3	6	2379421	2379426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_019965	CGC	2	6	2379443	2379448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_019965	GAG	2	6	2379486	2379491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_019965	CAT	2	6	2379550	2379555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_019965	GCCGC	2	10	2379563	2379572	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5120	NC_019965	GTC	2	6	2379586	2379591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_019965	C	7	7	2382875	2382881	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5122	NC_019965	CAC	2	6	2382885	2382890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_019965	ACCC	2	8	2382907	2382914	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5124	NC_019965	C	6	6	2382912	2382917	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5125	NC_019965	GCT	2	6	2382985	2382990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5127	NC_019965	CAG	3	9	2384158	2384166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5129	NC_019965	AGC	2	6	2384218	2384223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5255	NC_019965	CTT	2	6	2453803	2453808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5259	NC_019965	AGGCC	2	10	2454497	2454506	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5260	NC_019965	C	6	6	2454575	2454580	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5261	NC_019965	CGC	2	6	2454616	2454621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5262	NC_019965	GAC	2	6	2454623	2454628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5264	NC_019965	CCA	2	6	2454716	2454721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5265	NC_019965	GCG	2	6	2454751	2454756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5269	NC_019965	GC	3	6	2454890	2454895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5270	NC_019965	GGC	2	6	2454954	2454959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5275	NC_019965	CAG	2	6	2455056	2455061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5292	NC_019965	TCG	3	9	2455576	2455584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5373	NC_019965	CCG	2	6	2495277	2495282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5379	NC_019965	CG	3	6	2496154	2496159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5380	NC_019965	AGC	2	6	2496212	2496217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5382	NC_019965	G	6	6	2496239	2496244	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_019965	CA	4	8	2496270	2496277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5384	NC_019965	ACG	2	6	2496289	2496294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5385	NC_019965	ACGC	2	8	2496306	2496313	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5386	NC_019965	CAT	2	6	2496352	2496357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5390	NC_019965	GC	3	6	2499316	2499321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5391	NC_019965	ACT	2	6	2499331	2499336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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